Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms