Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms