Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBV7

Cops8, COP9 signalosome complex subunit 8, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops8Q8VBV7 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cops8Q8VBV7 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cops8Q8VBV7 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms