Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Top1mtQ8R4U6 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Top1mtQ8R4U6 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Top1mtQ8R4U6 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top1mtQ8R4U6 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Top1mtQ8R4U6 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Top1mtQ8R4U6 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top1mtQ8R4U6 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top1mtQ8R4U6 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top1mtQ8R4U6 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top1mtQ8R4U6 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top1mtQ8R4U6 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Top1mtQ8R4U6 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top1mtQ8R4U6 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top1mtQ8R4U6 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top1mtQ8R4U6 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top1mtQ8R4U6 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top1mtQ8R4U6 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Top1mtQ8R4U6 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top1mtQ8R4U6 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top1mtQ8R4U6 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top1mtQ8R4U6 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top1mtQ8R4U6 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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