Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc12Q8R344 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms