Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hecw1Q8K4P8 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms