Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms