Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

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Length 2,101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gtf3c1Q8K284 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gtf3c1Q8K284 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gtf3c1Q8K284 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Gtf3c1Q8K284 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Gtf3c1Q8K284 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Gtf3c1Q8K284 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Gtf3c1Q8K284 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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