Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Nek9Q8K1R7 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Nek9Q8K1R7 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Nek9Q8K1R7 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Nek9Q8K1R7 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Nek9Q8K1R7 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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