Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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FgbQ8K0E8 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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FgbQ8K0E8 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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FgbQ8K0E8 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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FgbQ8K0E8 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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FgbQ8K0E8 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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FgbQ8K0E8 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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FgbQ8K0E8 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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FgbQ8K0E8 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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FgbQ8K0E8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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