Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI2

Cdc34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc34Q8CFI2 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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