Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Hpf1Q8CFE2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Hpf1Q8CFE2 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Hpf1Q8CFE2 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Hpf1Q8CFE2 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Hpf1Q8CFE2 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Hpf1Q8CFE2 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Hpf1Q8CFE2 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Hpf1Q8CFE2 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Hpf1Q8CFE2 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Hpf1Q8CFE2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms