Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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Ercc8Q8CFD5 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
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Ercc8Q8CFD5 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Ercc8Q8CFD5 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Ercc8Q8CFD5 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Ercc8Q8CFD5 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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