Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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