Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY1

Samd4a, Protein Smaug homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd4aQ8CBY1 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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