Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Snx16Q8C080 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Snx16Q8C080 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Snx16Q8C080 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Snx16Q8C080 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Snx16Q8C080 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 519.4 ms