Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Mrpl42-202ENSMUST00000217777 455 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Clk4-202ENSMUST00000109111 1427 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Klrd1-203ENSMUST00000119520 919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 A330074H02Rik-201ENSMUST00000194667 1039 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm37907-201ENSMUST00000195644 846 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Tsg101-ps-201ENSMUST00000201023 1170 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm14415-201ENSMUST00000118260 1578 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm26944-201ENSMUST00000182265 633 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 AC158142.3-201ENSMUST00000226230 675 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Clec1b-201ENSMUST00000032262 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Klra7-202ENSMUST00000049304 1075 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Olfr922-201ENSMUST00000051004 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Olfr805-201ENSMUST00000078876 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Olfr1307-202ENSMUST00000099606 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms