Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ8

Fam53c, Protein FAM53C, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam53cQ8BXQ8 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam53cQ8BXQ8 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam53cQ8BXQ8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam53cQ8BXQ8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam53cQ8BXQ8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam53cQ8BXQ8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam53cQ8BXQ8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam53cQ8BXQ8 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam53cQ8BXQ8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam53cQ8BXQ8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam53cQ8BXQ8 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam53cQ8BXQ8 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam53cQ8BXQ8 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam53cQ8BXQ8 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam53cQ8BXQ8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam53cQ8BXQ8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam53cQ8BXQ8 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam53cQ8BXQ8 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam53cQ8BXQ8 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam53cQ8BXQ8 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam53cQ8BXQ8 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam53cQ8BXQ8 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam53cQ8BXQ8 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Fam53cQ8BXQ8 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Fam53cQ8BXQ8 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
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