Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Ctdsp2Q8BX07 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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