Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVP1

Triml1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml1Q8BVP1 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms