Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV13

Cops7b, COP9 signalosome complex subunit 7b, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7bQ8BV13 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops7bQ8BV13 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms