Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms