Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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Htatsf1Q8BGC0 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Htatsf1Q8BGC0 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Htatsf1Q8BGC0 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Htatsf1Q8BGC0 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htatsf1Q8BGC0 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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