Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms