Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Usp8Q80U87 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Usp8Q80U87 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Usp8Q80U87 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Usp8Q80U87 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
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Usp8Q80U87 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Usp8Q80U87 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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