Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
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