Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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