Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms