Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Scn4bQ7M729 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Scn4bQ7M729 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Scn4bQ7M729 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Scn4bQ7M729 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Scn4bQ7M729 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Scn4bQ7M729 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Scn4bQ7M729 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Scn4bQ7M729 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Scn4bQ7M729 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Scn4bQ7M729 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Scn4bQ7M729 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Scn4bQ7M729 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Scn4bQ7M729 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Scn4bQ7M729 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Scn4bQ7M729 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Scn4bQ7M729 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Scn4bQ7M729 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Scn4bQ7M729 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Scn4bQ7M729 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Scn4bQ7M729 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Scn4bQ7M729 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Scn4bQ7M729 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Scn4bQ7M729 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Scn4bQ7M729 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Scn4bQ7M729 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Scn4bQ7M729 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Scn4bQ7M729 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Scn4bQ7M729 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Scn4bQ7M729 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Scn4bQ7M729 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Scn4bQ7M729 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Scn4bQ7M729 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Scn4bQ7M729 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Scn4bQ7M729 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Scn4bQ7M729 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Scn4bQ7M729 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Scn4bQ7M729 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Scn4bQ7M729 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Scn4bQ7M729 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Scn4bQ7M729 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Scn4bQ7M729 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Scn4bQ7M729 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Scn4bQ7M729 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Scn4bQ7M729 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Scn4bQ7M729 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Scn4bQ7M729 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Scn4bQ7M729 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Scn4bQ7M729 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Scn4bQ7M729 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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