Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms