Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Higd1cQ76I25 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms