Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Atp8b3Q6UQ17 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Atp8b3Q6UQ17 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
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Atp8b3Q6UQ17 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Atp8b3Q6UQ17 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Atp8b3Q6UQ17 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Atp8b3Q6UQ17 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Atp8b3Q6UQ17 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Atp8b3Q6UQ17 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Atp8b3Q6UQ17 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Atp8b3Q6UQ17 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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