Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms