Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms