Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Tpm4Q6IRU2 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Tpm4Q6IRU2 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Tpm4Q6IRU2 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Tpm4Q6IRU2 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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