Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms