Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6DFW0 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6DFW0 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6DFW0 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6DFW0 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6DFW0 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6DFW0 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6DFW0 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6DFW0 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms