Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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