Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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