Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms