Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms