Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Zfp248Q640N4 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Zfp248Q640N4 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Zfp248Q640N4 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Zfp248Q640N4 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Zfp248Q640N4 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Zfp248Q640N4 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Zfp248Q640N4 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Zfp248Q640N4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Zfp248Q640N4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Zfp248Q640N4 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Zfp248Q640N4 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Zfp248Q640N4 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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