Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm5dQ62240 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms