Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
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PcolceQ61398 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
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PcolceQ61398 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
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PcolceQ61398 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PcolceQ61398 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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PcolceQ61398 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
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PcolceQ61398 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
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PcolceQ61398 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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PcolceQ61398 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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