Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104 ms