Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
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PtprnQ60673 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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PtprnQ60673 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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PtprnQ60673 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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PtprnQ60673 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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PtprnQ60673 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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PtprnQ60673 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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PtprnQ60673 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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PtprnQ60673 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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PtprnQ60673 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprnQ60673 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms