Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms