Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Rnf123Q5XPI3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Rnf123Q5XPI3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms