Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU09

Znf652, Zinc finger protein 652, mousemouse

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf652Q5DU09 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Znf652Q5DU09 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf652Q5DU09 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf652Q5DU09 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf652Q5DU09 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf652Q5DU09 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf652Q5DU09 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Znf652Q5DU09 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf652Q5DU09 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf652Q5DU09 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf652Q5DU09 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf652Q5DU09 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf652Q5DU09 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf652Q5DU09 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf652Q5DU09 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf652Q5DU09 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf652Q5DU09 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Znf652Q5DU09 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Znf652Q5DU09 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Znf652Q5DU09 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf652Q5DU09 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf652Q5DU09 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf652Q5DU09 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Znf652Q5DU09 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Znf652Q5DU09 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Znf652Q5DU09 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf652Q5DU09 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf652Q5DU09 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf652Q5DU09 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Znf652Q5DU09 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Znf652Q5DU09 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Znf652Q5DU09 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Znf652Q5DU09 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Znf652Q5DU09 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Znf652Q5DU09 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Znf652Q5DU09 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Znf652Q5DU09 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Znf652Q5DU09 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Znf652Q5DU09 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf652Q5DU09 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf652Q5DU09 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf652Q5DU09 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf652Q5DU09 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf652Q5DU09 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf652Q5DU09 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf652Q5DU09 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf652Q5DU09 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf652Q5DU09 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf652Q5DU09 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf652Q5DU09 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf652Q5DU09 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf652Q5DU09 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf652Q5DU09 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms