Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms